НККР объединяет специалистов России в области кристаллографии и осуществляет многогранную деятельность, направленную на развитие, координацию и широкий обмен информацией в области современной кристаллографии.

В центре внимания НККР находятся вопросы поиска, синтеза и получения новых кристаллических материалов, проблемы исследования атомного строения минералов, неорганических и органических веществ, биологически активных соединений, высокотемпературных сверхпроводников и биологических макромолекул. Деятельность НККР связана с организацией и проведением конференций, с распространением информации и организацией выставок новинок научной аппаратуры для кристаллографических исследований.

В тоже время Национальный комитет кристаллографов России осуществляет членство Российской Академии Наук в Международном Союзе Кристаллографов (МСК) и активно участвует в его работе. Представители российской кристаллографической науки входят практически во все выборные органы МСК. Академик Н.В.Белов был президентом МСК, академик Б.К.Вайнштейн, проф. В.И.Симонов и проф. Л.А.Асланов занимали посты вице-президентов, многие российские кристаллографы работали и работают в составе Исполкома МСК и его научных комиссиях.

Важнейшей областью деятельности МСК является проведение международных конгрессов, конференций, симпозиумов и школ по всем разделам кристаллографической науки. Кристаллографические конгрессы организуются МСК раз в три года. В промежутке между конгрессами Европейская Кристаллографическая Ассоциация ежегодно проводит Европейские кристаллографические конференции. Важное направление работ МСК связано с изданием международных научных журналов по кристаллографии ( серии журнала Акта Кристаллографика и Журнал прикладной кристаллографии) и периодическое издание справочников и таблиц по кристаллографии.

Во всех перечисленных направлениях деятельности МСК Национальный комитет кристаллографов России принимает самое активное участие.